Молекулярные инструменты плазмодия - Plasmodium molecular tools
Молекулярные инструменты плазмодия представляют собой набор методов для генетический манипулирование паразит род Плазмодий. Плазмодий виды были трудны для научного изучения, отчасти из-за неспособности многих стандартных биологических методов генетически изменить организм. Недавние исследования были направлены на преодоление этих технических барьеров, чтобы сделать паразита более доступным для изучения. Ниже приводится описание опубликованных методов генетического контроля в Плазмодий паразит.
Трансформация
- Электропорация
- загруженные эритроциты
Уровень ДНК
Регулирование транскрипции
- Трансактиваторная система на основе Tet - лиганд -индуцируемый контроль транскрипция гена на основе Система Тет (P. falciparum )[1]
Системы интеграции
- Rep20 опосредовано
- Bxb1 интеграза - сайт-специфическая стабильная генетическая интеграция в хромосомы при посредничестве микобактериофаг Сxb1 интегрировать (P. falciparum)[2]
Системы рекомбинации
- Flp / FRT - индуцированный сайт-специфичный рекомбинация /мутагенез с использованием дрожжи Система Flp / FRT (П. berghei )[3]
Системы транспозонов
- копилка - чешуекрылые сменный элемент для случайного, эффективного интегрирования ДНК в геном (P. falciparum)[4]
Уровень РНК
- РНКи
- антисмысловой
- саморазрушающийся рибозим - Неудачная попытка использовать индуцибельный саморасщепляющийся рибозим для контроля мРНК деградация слитых транскриптов (P. falciparum)[5]
Уровень протеина
- FKBP область дестабилизации - лиганд (Shld1) -регулируемый домен, способствующий деградации слитого белка (P. falciparum)[6]
- Область дестабилизации DHFR - лиганд (Триметоприм ) -регулируемый домен, способствующий деградации гибридный белок P. falciparum. Благодаря тому, что белок помечен доменом деградации DHFR из Кишечная палочка, а также GFP и HA-тег, уровень белка можно регулировать, сотовый может быть определена локализация белка, и белок может быть очищен от культивируемых паразитов.[7]
Рекомендации
- ^ Мейснер, М; Krejany, E; Гилсон, PR; Де Конинг-Уорд, TF; Солдати, Д; Крабб, Б.С. (2005). «Экспрессия трансгена, регулируемая аналогами тетрациклина в Плазмодий falciparum стадии крови с использованием Toxoplasma gondii трансактиваторы ". PNAS. 102 (8): 2980–2985. Дои:10.1073 / pnas.0500112102. ЧВК 548799. PMID 15710888.
- ^ Нкрума, LJ; Мюле, РА; Моура, Пенсильвания; Ghosh, P; Hatfull, GF; Джейкобс-младший, WR; Фидок, Д.А. (2006). "Эффективная интеграция для конкретного сайта в Плазмодий falciparum хромосомы, опосредованные интегразой микобактериофага Bxb1 ". Методы природы. 3 (8): 615–621. Дои:10.1038 / nmeth904. ЧВК 2943413. PMID 16862136.
- ^ Карвалью, Т. Г.; Thiberge, S; Сакамото, H; Менар, Р. (2004). «Условный мутагенез с использованием сайт-специфической рекомбинации в Плазмодий бергей трансактиваторы ". PNAS. 101 (41): 14931–14936. Дои:10.1073 / pnas.0404416101. ЧВК 522007. PMID 15465918.
- ^ Балу, Б; Shoue, DA; Фрейзер-младший, MJ; Адамс, JH (2005). «Высокоэффективное преобразование Плазмодий falciparum подвижным элементом чешуекрылых копилка". PNAS. 102 (45): 16391–16396. Дои:10.1073 / pnas.0504679102. ЧВК 1275597. PMID 16260745.
- ^ Агоп-Нерсесян (2008). «Функциональная экспрессия рибозимов в Apicomplexa: К экзогенному контролю экспрессии генов путем индуцибельного расщепления РНК». Международный журнал паразитологии. 38 (6): 673–81. Дои:10.1016 / j.ijpara.2007.10.015. PMID 18062972.
- ^ Армстронг, CM; Голдберг, DE (2007). "Домен дестабилизации FKBP модулирует уровни белка в Плазмодий falciparum". Методы природы. 4 (12): 1007–1009. Дои:10.1038 / nmeth1132. PMID 17994030.
- ^ Муралидхаран, V; Голдберг, DE (2011). "Функция повторения аспарагина в Плазмодий falciparum белок, оцениваемый с помощью регулируемой флуоресцентной аффинной метки ". PNAS. 108 (11): 4411–4416. Дои:10.1073 / pnas.1018449108. ЧВК 3060247. PMID 21368162.