Гаплогруппа Т (мтДНК) - Haplogroup T (mtDNA)

Гаплогруппа T
Возможное время происхождения25 149 ± 4 668 лет до настоящего времени
Возможное место происхожденияБлижний Восток
ПредокJT
ПотомкиТ1 и Т2
Определение мутацийG709A, G1888A, A4917G, G8697A, T10463C, G13368A, G14905A, A15607G, G15928A, C16294T

Гаплогруппа T это митохондриальная ДНК человека (мтДНК) гаплогруппа. Считается, что он возник около 25 100 лет назад в Ближний Восток.

Происхождение

Митохондриальная клада T происходит от гаплогруппы JT, который также дал начало мтДНК гаплогруппа J. Считается, что материнская клада T произошла от Ближний Восток (Бермишева 2002 ).

Распределение

Прогнозируемое пространственное частотное распределение для гаплогруппы T.

Базальная гаплогруппа T * находится среди Алжирцы в Оран (1,67%) и Регулировать Сахрави (0.93%).[1] Он также распространяется среди Soqotri (1.2%).[2]

Гаплогруппа T присутствует в гаплогруппе низких частот по всей Западной и Центральной Азии и Европе, с разной степенью распространенности и, безусловно, могла присутствовать в других группах из окружающих областей. T встречается примерно у 10% коренных европейцев.[3][4] Это также распространено среди современных Иранцы. На основе выборки из более чем 400 современных иранцев (Кивисилд и Мецпалу 2003 ), гаплогруппа T представляет примерно 8,3% населения (примерно 1 из 12 человек), причем более специфичный подтип T1 составляет примерно половину из них. Кроме того, конкретный подтип T1 имеет тенденцию находиться дальше на восток и распространен в Среднеазиатский и современный Тюркский популяции (Лалуэза-Фокс 2004 ), которые населяют большую часть той же территории, что и древние Сака, Сарматский, Андроново, и другие предполагаемые иранские народы 2-го и 1-го тысячелетий до нашей эры. Lalueza-Fox et al. (2004) также обнаружили несколько последовательностей T и T1 в древних захоронениях, в том числе Курганы, в казахской степи в XIV-X вв. до н.э., а также позже в I тыс. до н.э. Они совпадают с последней частью андроновского периода и сакским периодом в регионе.[5]

Географическое распределение внутри субклада T2 сильно варьируется, в зависимости от соотношения субгаплогруппы T2e и T2b, которое, как сообщается, варьируется в 40 раз в исследуемых популяциях, от низкого в Великобритании и Ирландии до высокого в Саудовской Аравии (Бедфорд 2012 ). Внутри подгаплогруппы T2e очень редкий мотив идентифицируется среди сефардских евреев Турции и Болгарии и подозреваемых конверсос из Нового Света (Бедфорд 2012 ).

Встречается у сванской популяции с Кавказа (Грузия) T * 10,4% и T1 4,2%. T1a1a1 особенно распространен в странах с высоким уровнем Y-гаплогруппы R1a, таких как Центральная и Северо-Восточная Европа. Клада также встречается повсюду в Центральной Азии и в глубине Северной Азии, вплоть до Монголии на восток.

T2c и T2d, по-видимому, имеют ближневосточное происхождение примерно во время Последний ледниковый максимум (LGM) и недавние расселения в Европе. Большая часть T2c состоит из гаплогруппы T2c1. Помимо пика на Кипре, T2c1 наиболее распространен в Персидский залив региона, но также встречается в Леванте и в Средиземноморской Европе с более широким распространением на очень низких уровнях.[6]

Т2 также встречается у сокотрийцев (7,7%).[2]

Археология

Wilde et al. (2014) протестировали образцы мтДНК из Ямная культура, предполагаемая родина Протоиндоевропейский компьютерные колонки. Они нашли T2a1b посередине Поволжье и Болгария, и T1a как в центральных Украина и Средняя Волга. Частота T1a и T2 в образцах ямны составляла 14,5% каждая, что на процент выше, чем в любой стране сегодня, и встречается только с такими же высокими частотами среди Удмуртов Волго-Уральского региона.[7]

Гаплогруппа T также была обнаружена среди Иберомавр образцы датируются Эпипалеолит на Афалу доисторическое место в Алжир. У одного древнего человека был субклад T2b (1/9; 11%).[8] Кроме того, гаплогруппа T наблюдалась среди древнеегипетский мумии, раскопанные на Абусир эль-Мелек археологические раскопки в Среднем Египте, датируемые доПтолемеев /поздно Новое Королевство (T1, T2), птолемеевский (T1, T2) и Римский (недифференцированные Т, Т1) периоды.[9] Окаменелости, раскопанные на территории позднего неолита Келиф-эль-Боруд в Марокко, которые были датированы примерно 3000 г. до н.э., также были замечены с субкладом T2.[10] Кроме того, гаплогруппа T наблюдалась в древних Гуанчи окаменелости, раскопанные в Гран-Канария и Тенерифе на Канарские острова, которые были датированы радиоуглеродом между VII и XI веками нашей эры. Кладоносные особи были ингумированы на стоянке Тенерифе, причем один экземпляр оказался принадлежащим к субкладе T2c1d2 (1/7; 14%).[11]

Африка

В Африке гаплогруппа T в основном встречается среди Афро-азиатский -говорящие популяции, включая базальную кладу Т *.[1] Некоторые небазальные T клады также часто встречаются среди Нигер-Конго -Говорящий Serer из-за диффузии из Магриб, вероятно, с распространением ислама и городских цивилизаций.[12]

численность населенияМесто расположенияСемья языковNЧастотаИсточник
АмхараЭфиопияАфро-азиатский> семитский5/1204.17%Кивисилд 2004
БежаСуданАфро-азиатский> кушитский1/482.1%Хасан 2009
Бета ИзраильЭфиопияАфро-азиатский> кушитский0/290.00%Бехар 2008a
КоптЕгипетАфро-азиатский> египетский5/2917.2%Хасан 2009
Дауро К.ЭфиопияАфро-азиатский> Омотик2/1371.46%Кастри 2008 и Боаттини 2013
Египтяне (Эль-Хайез)ЕгипетАфро-азиатский> семитский10/3528.6%Куянова 2009
ЭфиопияЭфиопияНеопределенный2/772.60%Соареш 2011
Эфиопский еврейЭфиопияАфро-азиатский> кушитский0/410.00%Не 2011
GurageЭфиопияАфро-азиатский> семитский0/210.00%Кивисилд 2004
ХамерЭфиопияАфро-азиатское> Омотическое0/110.00%Кастри 2008 и Боаттини 2013
ОнготаЭфиопияАфро-азиатский> кушитский0/190.00%Кастри 2008 и Боаттини 2013
ОромоЭфиопияАфро-азиатский> кушитский0/330.00%Кивисилд 2004
TigraiЭфиопияАфро-азиатский> семитский3/446.82%Кивисилд 2004
ДаасанахКенияАфро-азиатский> кушитский0/490.00%Полони 2009
ЭльмолоКенияАфро-азиатский> кушитский0/520.00%Кастри 2008 и Боаттини 2013
ЛуоКенияНило-Сахара0/490.00%Кастри 2008 и Боаттини 2013
МасаиКенияНило-Сахара0/810.00%Кастри 2008 и Боаттини 2013
НайробиКенияНигер-Конго0/1000.00%Brandstatter 2004
НьянгатомКенияНило-Сахара0/1120.00%Полони 2009
РендильКенияАфро-азиатский> кушитский0/170.00%Кастри 2008 и Боаттини 2013
СамбуруКенияНило-Сахара0/350.00%Кастри 2008 и Боаттини 2013
ТурканаКенияНило-Сахара0/510.00%Кастри 2008 и Боаттини 2013
ХутуРуандаНигер-Конго0/420.00%Кастри 2009
ДинкаСуданНило-Сахара0/460.00%Крингс 1999
СуданСуданНеопределенный3/1022.94%Соареш 2011
BurungeТанзанияАфро-азиатский> кушитский0/380.00%Тишкофф 2007
ДатогаТанзанияНило-Сахара1/571.75%Тишкофф 2007 и Рыцарь 2003
ИракТанзанияАфро-азиатский> кушитский0/120.00%Рыцарь 2003
СукумаТанзанияНигер-Конго0/320.00%Тишкофф 2007 и Рыцарь 2003
ТуруТанзанияНигер-Конго0/290.00%Тишкофф 2007
ЙеменцыЙеменАфро-азиатский> семитский1/1140.88%Кивисилд 2004

Азия

Европа

Субклады

Схематическое дерево гаплогруппы мтДНК T. Возраст (в ка ) указаны оценки максимального правдоподобия, полученные для всего генома мтДНК.

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы I основано на статье (van Oven 2008 ) и последующие опубликованные исследования (Бехар 2012b ). Для краткости только первые три уровня субклады (ветви) показаны.

  • Т
    • Т1
      • T1a
        • T1a1
      • T1b
    • Т2
      • T2a
        • T2a1
      • T2b
        • T2b1
        • T2b2
        • T2b3
        • T2b4
        • T2b5
        • T2b6
      • T2c
        • T2c1
      • T2d
      • T2e
        • T2e2
      • T2f
        • T2f1
      • T2g

Вопросы здравоохранения

Одно исследование показало, что гаплогруппа T связана с повышенным риском ишемическая болезнь сердца (Sanger 2007 ). Однако некоторые исследования также показали, что люди гаплогруппы T менее склонны к сахарный диабет (Chinnery 2007 и Гонсалес 2012).

Несколько предварительных медицинских исследований показали, что гаплогруппа T может оказывать некоторое сопротивление обоим болезнь Паркинсона и Болезнь Альцгеймера.[нужна цитата ]

Одно исследование показало, что среди населения Испании гипертрофическая кардиомиопатия (HCM), также называемая гипертрофической обструктивной кардиомиопатией или HOCM, чаще встречается у тех, кто принадлежит к родословной Т2, чем у тех, кто принадлежит к другим материнским гаплогруппам.[13] Неизвестно, является ли это специфическим для этого подкласса гаплогруппы T или является фактором риска, общим для всей гаплогруппы T. Со статистически значимой разницей, обнаруженной в такой небольшой выборке, может быть рекомендовано для тех, кто имеет известную материнскую гаплогруппу T. родословной, чтобы знать об этом и попросить своего врача проверить доказательства этого состояния при обычном обследовании в раннем возрасте. Обычно это бессимптомно и увеличивает риск внезапной сердечной смерти, что часто случается с теми, кто уже в подростковом возрасте, и может затронуть тех, кто ведет активный образ жизни и не имеет других факторов риска.[14]

Некоторые медицинские исследования показали, что митохондриальная гаплогруппа T связана с уменьшением подвижность сперматозоидов у мужчин, хотя эти результаты были оспорены (Мишмар 2002 ). Согласно Departamento de Bioquimica y Biologica Molecular y Celular, Universidad de Zaragoza, гаплогруппа T может предрасполагать к астенозооспермия (Руис-Песини 2000 ). Однако эти результаты были оспорены из-за небольшого размера выборки в исследовании (Мишмар 2002 ).

Известные участники

Вовремя BBC One документальный Познакомьтесь с Иззардами актер и комик Эдди Иззард узнает, что его митохондриальная ДНК относится к гаплогруппе T, в частности к субкладу T2f1a1.[15]

Николай II России

Последний русский Царь, Николай II, как было показано, принадлежит гаплогруппе T, в частности, субкладу T2 (Иванов 1996 ). Предполагая, что все соответствующие родословные верны, это включает всех потомков по женской линии его предка по женской линии. Варвара Целье (1390–1451), жена Сигизмунд, император Священной Римской империи. Это включает большое количество европейских дворян, в том числе Георг I Великобритании и Фридрих Вильгельм I Прусский (сквозь Электресс София Ганноверская ), Карл I Англии, Георг III Соединенного Королевства, Георг V Соединенного Королевства, Карл X Густав Швеции, Густав Адольф из Швеции, Морис Нассау, принц Оранский, Олав V из Норвегии, и Георг I Греции.

Смотрите также

Генетика

Магистральное дерево мтДНК

Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ

Рекомендации

Сноски

Цитаты

  1. ^ а б Асмахан Бекада; Лара Р. Арауна; Тахрия Деба; Франческ Калафель; Сорайя Бенхамамуш; Дэвид Комас (24 сентября 2015 г.). «Генетическая неоднородность алжирских популяций человека». PLOS ONE. 10 (9): e0138453. Bibcode:2015PLoSO..1038453B. Дои:10.1371 / journal.pone.0138453. ЧВК  4581715. PMID  26402429.; Стол S5
  2. ^ а б Черный Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, выявленное генетическим разнообразием митохондрий и Y-хромосомы» (PDF). Американский журнал физической антропологии. 138 (4): 439–447. Дои:10.1002 / ajpa.20960. PMID  19012329. Архивировано из оригинал (PDF) 6 октября 2016 г.. Получено 13 июн 2016.
  3. ^ Брайан Сайкс (2001). Семь дочерей Евы. Лондон; Нью-Йорк: Bantam Press. ISBN  978-0393020182.
  4. ^ "Материнское происхождение". Оксфордские предки. Архивировано из оригинал 15 июля 2017 г.. Получено 7 февраля 2013.
  5. ^ Беннет, Кейси; Кестле, Фредерика А. (2010). «Исследование древней ДНК Западной Сибири и саргатской культуры». Человеческая биология. 82 (2): 143–156. arXiv:1112.2014. Дои:10.3378/027.082.0202. PMID  20649397. S2CID  54566651.
  6. ^ Пала, М; Olivieri, A; Ахилли, А; Accetturo, M; Мецпалу, Э; Рейдла, М; Тамм, Э; Кармин, М; Рейсберг, Т; Хушиар Кашани, B; Перего, UA; Каросса, V; Гандини, F; Pereira, JB; Соарес, P; Angerhofer, N; Рычков, С; Аль-Захери, Н. Карелли, V; Санати, MH; Houshmand, M; Hatina, J; Маколей, V; Перейра, L; Вудворд, С.Р .; Дэвис, Вт; Гэмбл, C; Baird, D; Семино, О; Виллемс, Р. Торрони, А; Ричардс, МБ (4 мая 2012 г.). «Сигналы митохондриальной ДНК поздней ледниковой реколонизации Европы из ближневосточных рефугиумов». Американский журнал генетики человека. 90 (5): 915–924. Дои:10.1016 / j.ajhg.2012.04.003. ЧВК  3376494. PMID  22560092.http://haplogroup.org/sources/mitochondrial-dna-signals-of-late-glacial-recolonization-of-europe-from-near-eastern-refugia/
  7. ^ Уайльд, Сандра (2014). «Прямые доказательства положительного отбора пигментации кожи, волос и глаз у европейцев за последние 5000 лет». Труды Национальной академии наук. 111 (13): 4832–4837. Bibcode:2014PNAS..111.4832W. Дои:10.1073 / pnas.1316513111. ЧВК  3977302. PMID  24616518.
  8. ^ Кефи, Рим; и другие. (2018). «О происхождении иберомавров: новые данные на основе древней митохондриальной ДНК и филогенетического анализа популяций афалу и тафоральта». Митохондриальная ДНК, часть А. 29 (1): 147–157. Дои:10.1080/24701394.2016.1258406. PMID  28034339. S2CID  4490910.
  9. ^ Schuenemann, Verena J .; и другие. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды». Nature Communications. 8: 15694. Bibcode:2017НатКо ... 815694S. Дои:10.1038 / ncomms15694. ЧВК  5459999. PMID  28556824.
  10. ^ Фрегель; и другие. (2018). «Древние геномы из Северной Африки свидетельствуют о доисторических миграциях в Магриб как из Леванта, так и из Европы» (PDF). bioRxiv  10.1101/191569.
  11. ^ Родригес-Варела; и другие. (2017). «Геномный анализ человеческих останков с Канарских островов до европейского завоевания выявил близкое родство с современными североафриканцами». Текущая биология. 27 (1–7): 3396–3402.e5. Дои:10.1016 / j.cub.2017.09.059. PMID  29107554. Получено 28 октября 2017.
  12. ^ Болл, Эдвард (2007). Генетическая цепочка: изучение семейной истории через ДНК. Саймон и Шустер. п. 233. ISBN  978-1416554257. Получено 31 мая 2016.
  13. ^ Кастро, М. (2006). «Гаплогруппы митохондриальной ДНК у испанских пациентов с гипертрофической кардиомиопатией». Инт Дж Кардиол. 112 (2): 202–6. Дои:10.1016 / j.ijcard.2005.09.008. PMID  16313983.
  14. ^ Чен, Майкл. «Гипертрофическая кардиомиопатия - Медицинская энциклопедия». Медлайн Плюс. Национальная медицинская библиотека. Получено 2015-10-03.
  15. ^ Знакомьтесь с Иззардами: линия мамы. BBC One. 2013-03-12. 48 минут в.


Сайты

дальнейшее чтение

внешняя ссылка