Гаплогруппа L1 (мтДНК) - Haplogroup L1 (mtDNA) - Wikipedia

Гаплогруппа L1
Возможное время происхождения107 600–174 300 YBP[1]
Возможное место происхожденияЦентральная Африка
ПредокL1-6
ПотомкиL1b, L1c
Определение мутаций3666, 7055, 7389, 13789, 14178, 14560[2]
Прогнозируемое пространственное распределение гаплогруппы L1 в Африке.

Гаплогруппа L1 это митохондриальная ДНК человека (мтДНК) гаплогруппа. Это наиболее распространено в Центральная Африка и Западная Африка Он расходился с L1-6 около 140000 лет назад (140.6+33.7
−33.0 кя 95% ДИ ).[3]Его появление связано с ранним население Африки анатомически современными людьми во время Eemian, и сейчас он в основном находится в Африканские пигмеи.

Распределение

Гаплогруппа L1 чаще всего встречается в Центральная Африка и Западная Африка. Достигает самой высокой частоты среди Мбенга Пигмеи Вполне вероятно, что раньше он был более широко распространен и был ограничен нынешним ареалом в результате Миграция банту (что во многом связано с гаплогруппой L2 ).[4]Гаплогруппа L1 обнаружена в образцах с островного кладбища в г. Кулубнарти, Судан, которые датируются Ранний христианин период (550–800 гг. нашей эры).[5]Древний Стакан культуры человек на Камино де лас Йесерас в Испания (Сан-Фернандо-де-Энарес, Мадрид; [I4245 / RISE695] F) также было обнаружено, что он несет митохондриальную гаплогруппу L1b1a.[6]

Филогения

Карты интерполяции для гаплогрупп L1b и L1c.

L1 имеет две ветви, L1c и L1b (ранее названные гаплогруппы L1d, L1k, L1a, L1f были[год нужен ] переклассифицирован в гаплогруппу L0, как L0d, L0k, L0a, L0f; L1e как L5).

L1c

Гаплогруппа L1c возник около 85 тыс. лет назад. Наиболее часто он встречается в Западной и Центральной Африке, особенно среди Мбенга Пигмей народы. (посмотреть карту ).[7] Среди мбенги его носят 100% Ба-Кола, 97% Ба-Бензеле, и 77% Биака.[8] Другие популяции, в которых особенно распространен L1c, включают Тикар (100%), Люди бака из Габон (97%) и Камерун (90%),[9] то Бакоя (97%), а Ба-Бонго (82%).[7] Распространен также в Сан-Томе (20%) и Ангола (16–24%).[10]

Филогения:[2]

  • L1c
    • L1c1'2'4'6
      • L1c1
        • L1c1a
          • L1c1a1
            • L1c1a1a
              • L1c1a1a1
                • L1c1a1a1a
                • L1c1a1a1b
                  • L1c1a1a1b1
              • L1c1a1a2
            • L1c1a1b
          • L1c1a2
            • L1c1a2a
              • L1c1a2a1
              • L1c1a2a2
            • L1c1a2b
            • L1c1a2c
        • L1c1b'c'd
          • L1c1b
          • L1c1c'd
            • L1c1c
            • L1c1d
      • L1c2'4
        • L1c2
          • L1c2a
            • L1c2a1
              • L1c2a1a
              • L1c2a1b
            • L1c2a2
          • L1c2b
            • L1c2b1
            • L1c2b2
        • L1c4
          • L1c4a
          • L1c4b
      • L1c6
    • L1c3
      • L1c3a
        • L1c3a1
        • L1c3a1a
      • L1c3b'c
        • L1c3b
          • L1c3b1
            • L1c3b1a
            • L1c3b1b
          • L1c3b2
        • L1c3c

L1b

Гаплогруппа L1b намного более поздний, датируется примерно 10 тыс. лет назад. Часто в Западная Африка. Он также был найден в Мозамбик (1%), Эфиопия (2%), Египет (1%), Долина Нила (4%), Кунг (1%), Кабо-Верде (8%), Сенегал (17–20%), Нигер /Нигерия (15%), Гвинея-Бисау (11%), Марокко (4–5%), и Алжир (1–2%).[11]

Филогения:[2]

  • L1b
    • L1b1
      • L1b1a
        • L1b1a1'4
          • L1b1a1
          • L1b1a4
        • L1b1a2
          • L1b1a2a
        • 189
          • L1b1a3
            • L1b1a3a
              • L1b1a3a1
        • L1b1a5
        • L1b1a6
        • L1b1b7

Смотрите также

Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ

Рекомендации

  1. ^ Соарес, Педро; Лука Эрмини; Ноэль Томсон; Мару Мормина; Тереза ​​Рито; Арне Рёль; Антонио Салас; Стивен Оппенгеймер; Винсент Маколей; Мартин Б. Ричардс (4 июня 2009 г.). «Коррекция дополнительных данных для очищающего отбора: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека». Американский журнал генетики человека. 84 (6): 82–93. Дои:10.1016 / j.ajhg.2009.05.001. ЧВК  2694979. PMID  19500773.
  2. ^ а б c ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386 – E394. Дои:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Архивировано из оригинал 4 декабря 2012 г.. Получено 2009-05-20.
  3. ^ «Исправление для очищающего отбора: дополнительный материал по усовершенствованным митохондриальным молекулярным часам человека (стр. 82)» (PDF). 2009: 89. Архивировано с оригинал (PDF) на 2009-12-29. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  4. ^ Сильва, Марина; Альшамали, Фарида; Сильва, Паула; Каррильо, Карла; Мандлат, Флавио; Хесус Тровоада, Мария; Черный Виктор; Перейра, Луиза; Соарес, Педро (2015). «60 000 лет взаимодействий между Центральной и Восточной Африкой, документально подтвержденных основной африканской митохондриальной гаплогруппой L2». Sci. Представитель. 5: 12526. Bibcode:2015НатСР ... 512526С. Дои:10.1038 / srep12526. ЧВК  4515592. PMID  26211407.
  5. ^ Сирак, Кендра; Френандес, Даниэль; Новак, Марио; Ван Гервен, Деннис; Пинхаси, Рон (2016). Тезисы докладов Межконгресса IUAES 2016 - Сообщество разделилось? Выявление генома (ов) сообщества средневековой Кулубнарти с помощью секвенирования следующего поколения. IUAES.
  6. ^ Иньиго Олальде и другие. Феномен стакана и геномная трансформация Северо-Западной Европы, 2017
  7. ^ а б Кинтана-Мурчи; и другие. (2008). «Материнские следы глубокого общего предка и асимметричный поток генов между пигмеями-охотниками-собирателями и фермерами, говорящими на банту». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (5): 1596–601. Bibcode:2008PNAS..105.1596Q. Дои:10.1073 / pnas.0711467105. ЧВК  2234190. PMID  18216239.
  8. ^ Сара А. Тишкофф и др. 2007 г., История щелкающих популяций Африки на основе генетической изменчивости мтДНК и Y-хромосомы. Молекулярная биология и эволюция 2007 24 (10): 2180-2195
  9. ^ Lluis Quintana-Murci et al. Разнообразие мтДНК в Центральной Африке: от собирательства охотников до земледелия. CNRS-Institut Pasteur, Париж
  10. ^ Батини, Кьяра и др. 2006 г., Филогеография митохондриальной гаплогруппы L1c человека: генетические сигнатуры предыстории Центральной Африки
  11. ^ Роза, Александра; и другие. (2004). «Профиль мтДНК гвинейцев из Западной Африки: на пути к лучшему пониманию региона Сенегамбия» (PDF). Анналы генетики человека. 68 (4): 340–52. Дои:10.1046 / j.1529-8817.2004.00100.x. PMID  15225159. S2CID  15391342. Получено 5 июн 2017.

Примечания

внешняя ссылка