Хакробия - Hacrobia

Хакробия
Gephyrocapsa oceanica color.jpg
В кокколитофора Gephyrocapsa Oceanica
Научная классификация е
Домен:Эукариоты
(без рейтинга):Биконта
(без рейтинга):Хромальвеолаты
Подцарство:Хакробия
Окамото и др., 2009 г.
Группы
Синонимы
  • CCTH
  • Эукариомонады

В скопление криптомонад-гаптофитов предлагаемая монофилетическая группировка[1] одноклеточных эукариоты которые не включены в SAR супергруппа. Для группы использовалось несколько альтернативных имен, в том числе Хакробия (от «ha-» относится к Haptophyta, «-cr-» относится к криптомонадам, а «-bia» - к общий суффикс, относящийся к жизни );[2] CCTH (расшифровывается как Cryptophyta, Centrohelida, Telonemia и Haptophyta);[3] и «Eukaryomonadae».[4]

По состоянию на февраль 2012 г., неясно, является ли эта группа монофилетический или нет; результаты филогенетических исследований «часто зависят от выбора таксонов и набора данных о генах».[3] Два исследования 2012 года дали противоположные результаты.[3][5]

Члены

Дальнейшая информация: Викивиды: Hacrobia

В прошлом, гетероконты, гаптофиты, и криптомонады иногда объединялись в группу, известную как хромисты.[6] Хотя теперь гетероконты разделены, Cryptophyta и Haptophyta в некоторых исследованиях считаются тесно связанными.[7][8] (и иногда их просто называют группой «Cryptophyta + Haptophyta»).[9] В документе 2009 г. было высказано предположение, что Телонемия и центрохелиды может образовывать кладу с криптофитами и гаптофитами.[10] В пикобилифиты могут принадлежать к этой группе, но о них слишком мало известно, чтобы их можно было с уверенностью классифицировать.[2]

Несколько недавних исследований пришли к выводу, что Haptophyta и Cryptophyta не образуют монофилетическую группу.[11] Первые являются сестринской группой Группа SAR, последний кластер с Archaeplastida (растения в широком смысле).[5] По состоянию на февраль 2012 г., остается неясным, образует ли Hacrobia монофилетическую группу.[3]

Другое исследование[12] предложил следующую схему: центрохелиды связаны с гаптофиты и сформировать кладу Гаптиста; Haptista является сестринской группой SAR; Cryptista относятся к Archaeplastida; и Haptista + SAR является сестринским классом Cryptista + Archaeplastida.

Филогения

На основе работы, проделанной Silar 2016.[13][14]

Хакробия
 
Альвейдия

Alveidea[15]

 
Гаптиста
Центрогелиозоа

Centrohelea

 
Гаптофитина
Раппемонада

Rappephyceae

 
Гаптомонада
 

Павловофеи

 
 

Prymnesiophyceae

 
 
 
 
 
Криптиста s.l.
Корбихелия
Эндогелия

Endohelea

 
Корбистома
 

Picomonadea

 
 

Telonemea

 
 
 
Криптиста s.s.
Пальпития

Пальпита

 
Ролломонадия
Лейкокрипта

Лейкокриптей

 
Криптомонада
 

Гониомонада

 
 

Cryptophyceae

 
 
 
 
 
 

использованная литература

  1. ^ Сакагути М., Такисита К., Мацумото Т., Хашимото Т., Инагаки Ю. (июль 2009 г.). «Прослеживание эволюции гена EFL в сообществе криптомонад-гаптофитов: отдельные источники генов EFL в гаптофитах, фотосинтетических криптомонад и гониомонад». Ген. 441 (1–2): 126–31. Дои:10.1016 / j.gene.2008.05.010. PMID  18585873.
  2. ^ а б Okamoto, N .; Chantangsi, C .; Horák, A .; Leander, B .; Keeling, P .; Стаджич, Дж. Э. (2009). Стаджич, Джейсон Э. (ред.). «Молекулярная филогения и описание нового Katablepharid Roombia truncata gen. Et sp. Nov. И создание таксона Hacrobia nov». PLoS ONE. 4 (9): e7080. Bibcode:2009PLoSO ... 4,7080O. Дои:10.1371 / journal.pone.0007080. ЧВК  2741603. PMID  19759916.
  3. ^ а б c d Чжао, Сен; Бурки, Фабьен; Брат, Джон; Килинг, Патрик Дж .; Клавенесс, Даг; Шалчян-Тебризи, Кямран (2012). "Коллодиктион - древняя линия древа эукариот". Молекулярная биология и эволюция. 29 (6): 1557–68. Дои:10.1093 / molbev / mss001. ЧВК  3351787. PMID  22319147.
  4. ^ "ЕВКАРЬОМОНАДА". Получено 2015-03-01.
  5. ^ а б Бурки, Ф .; Okamoto, N .; Помберт, Дж. Ф. и Килинг, П. Дж. (2012). «Эволюционная история гаптофитов и криптофитов: филогеномные доказательства раздельного происхождения». Proc. Биол. Наука. 279 (1736): 2246–54. Дои:10.1098 / rspb.2011.2301. ЧВК  3321700. PMID  22298847.
  6. ^ Чурош М., Рогозин И.Б., Кунин Е.В. (май 2008 г.). «Чрезвычайно богатые интронами гены у альвеолатных предков, выведенные с помощью гибкого подхода максимального правдоподобия». Мол. Биол. Evol. 25 (5): 903–11. Дои:10.1093 / molbev / msn039. PMID  18296415.
  7. ^ Райс DW, Палмер JD (2006). «Исключительный горизонтальный перенос генов в пластидах: замена гена отдаленным бактериальным паралогом и доказательство того, что гаптофитные и криптофитные пластиды - сестры». BMC Biol. 4: 31. Дои:10.1186/1741-7007-4-31. ЧВК  1570145. PMID  16956407.
  8. ^ Аарон Орен; Р. Тейн Папке (1 июля 2010 г.). Молекулярная филогения микроорганизмов. Horizon Scientific Press. С. 190–. ISBN  978-1-904455-67-7. Получено 21 января 2011.
  9. ^ Риб В.К., Пеглар М.Т., Юн Х.С. и др. (Май 2009 г.). «Взаимоотношения хромальвеолатов в пределах широко отобранного дерева фотосинтетических протистов». Мол. Филогенет. Evol. 53 (1): 202–11. Дои:10.1016 / j.ympev.2009.04.012. PMID  19398025.
  10. ^ Бурки, Ф; Инагаки, Y; Bråte, J; Archibald, J .; Keeling, P .; Кавальер-Смит, Т; Сакагути, М; Хашимото, Т; Горак, А; Кумар, S; Klaveness, D; Якобсен, К.С.; Павловски, Дж; Шалчиан-Тебризи, К. (2009). «Крупномасштабный филогеномный анализ показывает, что две загадочные линии протистов, Telonemia и Centroheliozoa, связаны с фотосинтетическими хромальвеолатами». Геномная биология и эволюция. 1: 231–8. Дои:10.1093 / gbe / evp022. ЧВК  2817417. PMID  20333193. Архивировано из оригинал (Бесплатный полный текст) 10 июля 2012 г.
  11. ^ Борайн, Денис; Бринкманн, Хеннер; Петерсен, Йорн; Родригес-Эспелета, Найара; Стехманн, Александра; Демулен, Винсент; Роджер, Эндрю Дж .; Бургер, Гертрауд; Ланг, Б. Франц и Филипп, Эрве (2010), «Филогеномные доказательства раздельного приобретения пластидов у криптофитов, гаптофитов и страменопилов», Молекулярная биология и эволюция, 27 (7): 1698–1709, Дои:10.1093 / molbev / msq059, PMID  20194427
  12. ^ Бурки, Ф; Каплан, М; Тихоненков Д.В.; Златогурский, В; Минь, Британская Колумбия; Радайкина, Л.В.; Смирнов А; Мыльников АП; Килинг, П.Дж. (2016). «Распутывая раннюю диверсификацию эукариот: филогеномное исследование эволюционного происхождения Centrohelida, Haptophyta и Cryptista». Proc Biol Sci. 283 (1823): 20152802. Дои:10.1098 / rspb.2015.2802. ЧВК  4795036. PMID  26817772.
  13. ^ Силар, Филипп (2016), "Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes", HAL Архивы-обзоры: 1–462
  14. ^ Руджеро; и другие. (2015), «Классификация всех живых организмов высшего уровня», PLoS ONE, 10 (4): e0119248, Bibcode:2015PLoSO..1019248R, Дои:10.1371 / journal.pone.0119248, ЧВК  4418965, PMID  25923521
  15. ^ Кавальер-Смит, Т .; Chao, E. E .; Льюис, Р. (17 апреля 2018 г.), «Мультигенная филогения и клеточная эволюция хромистового инфра-королевства Rhizaria: контрастная организация клеток сестринских типов Cercozoa и Retaria», Протоплазма, 255 (5): 1517–1574, Дои:10.1007 / s00709-018-1241-1, ЧВК  6133090, PMID  29666938

внешние ссылки