VA РНК - VA RNA

VA РНК
RF00102.jpg
Идентификаторы
СимволVA
РфамRF00102
Прочие данные
РНК типГен
Домен (ы)Эукариоты; Вирусы
ТАКSO: 0005836
PDB структурыPDBe

В VA (вирусно-ассоциированная) РНК это тип некодирующая РНК нашел в аденовирус.[1][2] Он играет роль в регулировании перевод.[3] Есть две копии этой РНК, которые называются VAI или VA RNAI и VAII или VA RNAII. Эти два гена VA РНК представляют собой разные гены в геноме аденовируса. VA RNAI - это основной вид, у которого VA RNAII экспрессируется на более низком уровне. Ни один из транскриптов не полиаденилирован, и оба транскрибируются с помощью PolIII.

Функция

VAI стимулирует трансляцию как ранних, так и поздних вирусных генов, включая E3 и гексон.[4] VAII не стимулирует перевод. Анализы временной трансфекции показали, что VAI-РНК увеличивает стабильность связанных с рибосомами транскриптов.[5]

VAI РНК обрабатывается в клетке для создания РНК длиной 22 нуклеотида, которые могут действовать как миРНК или же miRNA.[6] РНК VAI функционирует как РНК-приманка для активированной двухцепочечной РНК. протеинкиназа R которые иначе фосфорилировали бы фактор инициации эукариот 2.

Структура

VA РНК состоит из двух стебель-петли разделены центральной областью, необходимой для работы.[7]

Рекомендации

  1. ^ Мэтьюз, МБ (1995). «Структура, функция и эволюция РНК, ассоциированных с аденовирусным вирусом». Curr Top Microbiol Immunol. 199: 173–187. PMID  7555067.
  2. ^ Кидд, AH; Garwicz D; Оберг М (1995). «Аденовирусы человека и обезьяны: филогенетические выводы из анализа генов VA РНК». Вирусология. 207: 32–45. Дои:10.1006 / viro.1995.1049. PMID  7871747.
  3. ^ Тиммапайя, B; Вайнбергер С; Schneider RJ; Шенк Т. (1982). «РНК аденовируса VAI необходима для эффективной трансляции вирусных мРНК на поздних сроках после заражения». Клетка. 31 (3, часть 2): 543–551. Дои:10.1016/0092-8674(82)90310-5. PMID  6297772.
  4. ^ Свенссон, К; Акусярви Г (1984). «Аденовирус VA RNAI: позитивный регулятор трансляции мРНК». Mol Cell Biol. 4 (4): 736–742. Дои:10.1128 / mcb.4.4.736. ЧВК  368790. PMID  6201722.
  5. ^ Страйкер, Р; Fritz DT; Левинсон А.Д. (1989). «Аденовирус VAI-РНК регулирует экспрессию генов, контролируя стабильность связанных с рибосомами РНК». EMBO J. 8 (9): 2669–2675. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1989.tb08407.x. ЧВК  401273. PMID  2583126.
  6. ^ Сано М., Като Ю., Тайра К. (2006). «Последовательно-специфическая интерференция малых РНК, полученных из РНК VAI аденовируса». FEBS Lett. 580 (6): 1553–1564. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.01.085. PMID  16472808.
  7. ^ Май; Мэтьюз МБ (1996). «Вторичная и третичная структура в центральном домене VA РНК I аденовируса 2 типа». РНК. 2 (9): 937–951. ЧВК  1369428. PMID  8809020.

внешняя ссылка