TPSAB1 - TPSAB1

TPSAB1
Белок TPSAB1 PDB 1a0l.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTPSAB1, TPS1, TPS2, TPSB1, триптаза альфа / бета 1, TPSB2, триптаза-2
Внешние идентификаторыOMIM: 191080 MGI: 96942 ГомолоГен: 55729 Генные карты: TPSAB1
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение TPSAB1
Геномное расположение TPSAB1
Группа16p13.3Начинать1,240,705 бп[1]
Конец1,242,554 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TPSAB1 207741 x at fs.png

PBB GE TPSAB1 205683 x at fs.png

PBB GE TPSAB1 207134 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003294

NM_010781

RefSeq (белок)

NP_077078
NP_003285

NP_034911

Расположение (UCSC)Chr 16: 1.24 - 1.24 МбChr 17: 25.37 - 25.37 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Триптаза альфа-1 и триптаза бета-1 находятся ферменты что у людей кодируются тем же TPSAB1 ген.[5][6] Бета-триптазы, по-видимому, являются основными изоферменты выражено в тучные клетки; тогда как в базофилы, преобладают альфа-триптазы.[7]

Функция

Триптазы включают семейство трипсиноподобных сериновых протеаз, семейство пептидаз S1. Триптазы ферментативно активны только как тетрамеры, стабилизированные гепарином, и они устойчивы ко всем известным ингибиторам эндогенных протеиназ. Несколько генов триптазы сгруппированы на хромосоме 16p13.3. Эти гены характеризуются несколькими отличительными чертами. Они имеют высококонсервативную 3'-UTR и содержат последовательности тандемных повторов на 5'-фланге и 3'-UTR, которые, как считается, играют роль в регуляции стабильности мРНК. Эти гены имеют интрон, расположенный непосредственно перед кодоном инициатора Met, который отделяет сайт инициации транскрипции от последовательности, кодирующей белок. Эта особенность характерна для триптаз, но необычна для других генов. Аллели этого гена демонстрируют необычное количество вариаций последовательности, так что когда-то считалось, что аллели представляют два отдельных гена, альфа и бета 1. Триптазы участвуют в качестве медиаторов в патогенезе астмы и других аллергических и воспалительных заболеваний.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172236 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033825 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Миллер Дж. С., Моксли Дж., Шварц Л. Б. (октябрь 1990 г.). «Клонирование и характеристика второй комплементарной ДНК триптазы человека». J Clin Invest. 86 (3): 864–70. Дои:10.1172 / JCI114786. ЧВК  296804. PMID  2203827.
  6. ^ Pallaoro M, Fejzo MS, Shayesteh L, Blount JL, Caughey GH (февраль 1999 г.). «Характеристика генов, кодирующих известные и новые триптазы тучных клеток человека на хромосоме 16p13.3». J Biol Chem. 274 (6): 3355–62. Дои:10.1074 / jbc.274.6.3355. PMID  9920877.
  7. ^ а б «Ген Entrez: триптаза TPSAB1 альфа / бета 1».

дальнейшее чтение