Производство семян и разнообразие генов - Seed production and gene diversity

Генетическое разнообразие часто является основным фактором, влияющим, например, на лесные культуры.

Групповая принадлежность популяции

Рассмотрим генофонд семенной сад урожай или другой источник семян от родителей. Генофонд велик, поскольку в семенной культуре много семян, поэтому нет генетический дрейф. Вероятность того, что первый ген происходит от генотипа i в семенном саду, равна pя, а вероятность того, что второй происходит от генотипа j, равна pj. Вероятность того, что эти два гена происходят от генотипов фруктовых садов i и j, идентичны по происхождению (IBD), равна θij. Это Методика малекота [1] (или «коэффициент родства»; «коэффициент родства» - аналогичный показатель, который можно вычислить) между генотипами i и j. Вероятность того, что любая пара генов является IBD, Θ, может быть найдена путем сложения всех возможных пар генов от N родителей. Формула для группового созревания (на основе которого можно получить разнообразие генов) семенных садовых культур.[2]

Θ = пяпjθij.
Групповую коанцестрию семенного сада можно разделить на два термина: один для самооценки, а другой - для кросс-коанцестрии.

Θ = пя2(1 + Fя)/2 + пяпjθij, последнее суммирование без учета j = i.

Рассмотрим простой случай. Если генотипы семенного сада не связаны между собой, второй член равен нулю, если инбридинга нет, первый член становится простым. Для отсутствия родства и инбридинга номер статуса (NS, эффективное количество родителей) становится

NS = 1/ пя2

Подобные, но менее развитые выражения использовались много раз раньше, они имеют сходство с концепцией эффективного размера популяции, определяемой в.[3]

Рекомендации

  1. ^ Малеко Г. Les mathématiques de l'hérédité. Париж: Masson & Cie, 1948.
  2. ^ Линдгрен Д. и Маллин Т.Дж. 1998. Родство и статусный номер у семенных садовых культур. Канадский журнал исследований леса 28: 276-283.
  3. ^ Робертсон А. (1961). Инбридинг в программах искусственного отбора. Genet Res 2: 189-194