Ноктюрнин - Nocturnin - Wikipedia

НОКТ
Человек Ноктюрнин (6MAL) .png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыНОКТ, CCR4L, Ccr4c, NOC, CCRN4L, ноктюрнин
Внешние идентификаторыOMIM: 608468 MGI: 109382 ГомолоГен: 7661 Генные карты: НОКТ
Расположение гена (человек)
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек)[1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное местоположение для NOCT
Геномное местоположение для NOCT
Группа4q31.1Начинать139,015,781 бп[1]
Конец139,045,939 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_012118

NM_009834

RefSeq (белок)

NP_036250

NP_033964

Расположение (UCSC)Chr 4: 139.02 - 139.05 МбChr 3: 51.22 - 51.25 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ноктюрнин человек гидролаза фермент, который участвует в метаболизме, и его экспрессия контролируется ритмической циркадные часы. Он кодируется геном NOCT, расположенным на хромосоме 4. Ноктюрнин содержит c-концевой структурный домен Семейство эндонуклеаз / экзонуклеаз / фосфатаз. Исследование, проведенное в январе 2019 года, показало, что НАДФ + и НАДФН являются прямыми целями Ноктюрнина.[5][6]

В Drosophila melanogaster ортолог Nocturnin Curled. Нокауты Завитого ведут к завитому крылу фенотип у плодовых мух. Фенотип скрученного крыла был впервые обнаружен Томас Хант Морган в 1915 г.[7] У мышей ортолог Nocturnin отвечает за контроль диеты и набора веса, нокаутные мыши не набирают вес, когда их помещают на диету с высоким содержанием жиров, по сравнению с нормальными мышами, содержащими ноктурнин.[8] На мышах также было показано, что ноктюрнин ритмично экспрессируется, даже когда мышей помещают в полную темноту, демонстрируя, что экспрессия ноктюрнина управляется внутренними часами нашего тела.[9]

Сотовая локализация

Было показано, что у Ноктюрнина Последовательность нацеливания на митохондрии, который расположен на n-конце белка.[5][6]

Ферментативная активность

Ранее считалось, что Ноктюрнин деаденилат мРНК метаболических генов,[10] но два исследования в 2018 году показали, что Ноктюрнин напрямую не обладает рибонуклеаза Мероприятия.[11][12] Исследование, проведенное в январе 2019 года, показало, что Ноктюрнин фосфатаза который действует непосредственно на НАДФ (H), удаляя 2 'фосфат.[5][6] Curled, ортолог дрозофилы, также оказался NADP (H) 2 'фосфатазой, что указывает на то, что ферментативная активность сохраняется от человека к плодовым мушкам.[5][6]

Структура

Ноктюрнин содержит c-концевой структурный домен Семейство эндонуклеаз / экзонуклеаз / фосфатаз (EEP). Его белковая складка аналогична белковой складке ДНКаза I, Эндонуклеаза AP, INPP5B, Сфингомиелин фосфодиэстераза, TDP2, PDE12, и CNOT6L. Как и у других членов EEP, пять консервативных каталитических остатков помогают координировать атом магния, для ноктюрнина двухвалентный металл участвует в активности НАДФ (H) фосфатазы. Первые структуры человеческого ноктюрнина были решены в 2017-2018 гг. (6BT1[12], 6BT2[12], и 6МАЛ[11]). Все три были из c-концевого EEP-подобного домена ноктурнина, связанного с его кофактор магний. В декабре 2018 года была определена первая структура ноктюрнина, связанного с его естественным субстратом, НАДФН. 6NF0.[5][6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000151014 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023087 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d е Estrella MA, Du J, Chen L, Rath S, Prangley E, Chitrakar A, Aoki T., Schedl P, Rabinowitz J, Korennykh A (2019). «Метаболиты НАДФ + и НАДФН являются мишенями циркадного белка ноктюрнина (курчавого)». bioRxiv. Дои:10.1101/534560.
  6. ^ а б c d е Estrella MA, Du J, Chen L, Rath S, Prangley E, Chitrakar A, Aoki T., Schedl P, Rabinowitz J, Korennykh A (май 2019 г.). «Метаболиты НАДФ + и НАДФН являются мишенями циркадного белка ноктюрнин (Curled)». Nature Communications. 10 (1): 2367. Bibcode:2019НатКо..10.2367E. Дои:10.1038 / s41467-019-10125-z. ЧВК  6542800. PMID  31147539. Сложить резюмеScience Daily.
  7. ^ Гронке С., Бикмейер I, Вундерлих Р., Джекл Х., Кунляйн Р.П. (2009). "curled кодирует гомолог дрозофилы циркадной деаденилазы позвоночных ноктюрнин". Генетика. 183 (1): 219–232. Дои:10.1534 / genetics.109.105601. ЧВК  2746146. PMID  19581445.
  8. ^ Green CB, Douris N, Kojima S, Strayer CA, Fogerty J, Lourim D, Keller SR, Besharse JC (2007). «Потеря ноктюрнина, циркадной деаденилазы, придает устойчивость к стеатозу печени и ожирению, вызванному диетой». PNAS. 104 (23): 9, 888–93. Дои:10.1073 / pnas.0702448104. ЧВК  1871564. PMID  17517647.
  9. ^ Ван И, Остербур Д.Л., Мегау П.Л., Тосини Дж., Фукухара С., Грин CB, Бешарс Дж.С. (2001). «Ритмическая экспрессия мРНК ноктюрнина во многих тканях мыши». Биология развития BMC. 1 (9): 9. Дои:10.1186 / 1471-213X-1-9. ЧВК  32249. PMID  11394964.
  10. ^ Баггс Дж. Э., Грин CB (2003). «Ноктюрнин, деаденилаза в сетчатке Xenopus laevis». Текущая биология. 13 (3): 189–198. Дои:10.1016 / S0960-9822 (03) 00014-9. PMID  12573214. S2CID  16337386.
  11. ^ а б Estrella MA, Du J, Коренных А (2018). «Кристаллическая структура каталитического домена ноктюрнина человека». Научные отчеты. 8 (1): 16294. Bibcode:2018НатСР ... 816294E. Дои:10.1038 / s41598-018-34615-0. ЧВК  6214945. PMID  30389976.
  12. ^ а б c Abshire ET, Chasseur J, Bohn JA, Del Rizzo PA, Freddolino PL, Goldstrohm AC, Trievel RC (2018). «В структуре ноктурнина человека обнаружен консервативный домен рибонуклеазы, который подавляет трансляцию транскрипта-мишени и его изобилие в клетках». Исследования нуклеиновых кислот. 46 (12): 6257–6270. Дои:10.1093 / нар / gky412. ЧВК  6158716. PMID  29860338.

внешняя ссылка

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9UK39 (Ноктюрнин) в PDBe-KB.