Nocardiaceae - Nocardiaceae

Nocardiaceae
Nocardia asteroides.png
Nocardia asteroides колонии
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Актинобактерии
Класс:
Актинобактерии
Порядок:
Актиномицеты
Подотряд:
Коринебактерины
Семья:
Nocardiaceae

Гаррити и другие. 2001
Роды

Нокардия
Родококк
Смарагдикокк
Микрополиспора (ныне несуществующий)

В Nocardiaceae площадь семья из аэробный, невзрачный, высокий G + C, Грамположительный актиномицеты которые обычно встречаются в почве и воде.[1] Члены этой семьи изолированы от Антарктика почвы.[2] Nocardiaceae представляют коккобациллы, нитчатые или, реже, фрагментированные и палисадные формы,[3] и нитчатые виды растут по морфологическому образцу ветвления, подобному грибковому гифы.[4]

Геномика

Nocardiaceae образуют монофилетическую кладу внутри Corynebacteriales как в 16S рРНК, так и в филогенетических деревьях на основе белков.[5][6] Количество сохраненные индели подписи и были идентифицированы консервативные сигнатурные белки, которые уникально обнаружены в родах Нокардия и Родококк, поддерживающий тесную связь между двумя родами.[6] Последние предложения были сделаны на основе 16S рРНК сигнатуры нуклеотидов и хемотаксономический маркеры, чтобы добавить роды Гордония, Скермания, Вильямсия, Миллисия, и Смарагдикокк к семейству Nocardiaceae.[5][7] Однако не было обнаружено никаких консервативных инделей сигнатур или белков, которые обычно являются общими для Нокардия, Родококк, и Гордония, полностью секвенированные члены предложенной ревизии Nocardiaceae.[6]

Патогенная способность

Некоторые виды колонизируют животных, а представители Нокардия и Родококк родов может вызвать инфекцию у людей и домашнего скота.[8] Многие члены этой семьи интегрируют миколиновые кислоты в их клеточная стенка, и в результате Nocardia spp. может быть ошибочно принят за микобактерии при просмотре под микроскопом после кислотостойкого окрашивания.[9]

Экологические последствия

Вспенивание сточных вод

Нокардия виды часто ответственны за накопление пены, которое происходит в активный ил в течение очистка сточных вод.[4][10][11][12] Биологическое пенообразование может быть проблематичным для процесса очистки воды, а накопление пены уменьшается за счет добавления поверхностно-активных веществ в сточные воды.[13][14]

Биоремедиация углеводородов

Почва Nocardiaceae может деградировать углеводороды (например. нефть дистилляты) и были предложены как биоремедиация средства для разлива в окружающую среду.[15]

Изменения номенклатуры

В 1980-х годах все виды Nocardiaceae, отнесенные к роду Микрополиспора были переданы в роды Нокардия или Nonomuraea в семье Streptosporangiaceae, или Сахарополиспора в семье Pseudonocardiaceae.[16] Это фактически положило конец официальному статусу этого рода, но это название сохраняется в более старых научных статьях.

использованная литература

  1. ^ Стакебрандт Э., Рейни Ф.А. и Н.Л. Уорд-Рейни. 1997 г. Предложение по новой иерархической системе классификации Actinobacteria classis nov.. Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47:479-491. В архиве 2011-05-15 на Wayback Machine
  2. ^ Эйслаби, Дж. Экосистемные процессы в незамерзающих ландшафтах Антарктики. «Бактерии, разлагающие углеводороды, в загрязненных нефтью почвах недалеко от базы Скотт, Антарктида». Стр. 257.
  3. ^ Кулич, С. и W.A. Pasculle. Окончательный диагноз - пневмония, внутригрудный лимфаденит и вторичный сепсис. Родококк обыкновенный. Медицинский факультет Питтсбургского университета. Проверено 20 октября 2007 года.
  4. ^ а б Биттон, Г. Микробиология сточных вод. «Пенная микробиология». стр. 229.
  5. ^ а б Ludwig, W .; Euzéby, J .; Schumann, P .; Busse, H. J. R .; Трухильо, М. Э .; Kämpfer, P .; Уитмен, В. Б. (2012). «Дорожная карта филума актинобактерий». Руководство по систематической бактериологии Bergey's. п. 1. Дои:10.1007/978-0-387-68233-4_1. ISBN  978-0-387-95043-3.
  6. ^ а б c Gao, B .; Гупта, Р. С. (2012). «Филогенетическая основа и молекулярные сигнатуры для основных кладов филума актинобактерий». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 76 (1): 66–112. Дои:10.1128 / MMBR.05011-11. ЧВК  3294427. PMID  22390973.
  7. ^ Чжи, X. -Y .; Li, W. -J .; Штакебрандт, Э. (2009). «Обновление структуры и определения последовательности гена 16S рРНК для более высоких рангов класса Actinobacteria, с предложением двух новых подотрядов и четырех новых семейств и исправленных описаний существующих более высоких таксонов». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 59 (3): 589–608. Дои:10.1099 / ijs.0.65780-0. PMID  19244447.
  8. ^ Кастеллани, А. и А.Дж. Чалмерс. 1919 г. Руководство по тропической медицине, 3-е изд., Williams Wood and Co., New York, p. 1040.
  9. ^ Нокардия: серьезное дело для коров. Изображения для презентаций с сайта: aids-images.ch. Проверено 20 октября 2007 года.
  10. ^ Блэколл, Л., Тандой, В., Дженкинс, Д. 1991. Непрерывные культурологические исследования с Nocardia amarae из активного ила и их значение для контроля пенообразования Nocardia. В архиве 2011-05-20 на Wayback Machine Res. J. Water Pollution Cont. Кормили. 63:44-50.
  11. ^ Питт П. и Д. Дженкинс. 1990 г. Причины и борьба с нокардиями в активном иле В архиве 2011-05-20 на Wayback Machine. Res. J. Water Pollution Cont. Кормили. 62:143-150.
  12. ^ Блэколл, Л.Л. 1994. Микроорганизмы в процессах активного ила и биопленки В архиве 2011-05-20 на Wayback Machine. Water Sci. Technol. 29:35-44.
  13. ^ Шао Й.Дж., Старр М., Капорис К., Ким Х.С., Дженкинс Д. 1997. Добавление полимера как решение проблемы вспенивания Nocardia. Вода Enviro. Res., 69:25-27.
  14. ^ Хо, К.Ф., Дженкинс, Д. 1991 Влияние поверхностно-активных веществ на пенообразование Nocardia в активном иле В архиве 2011-05-20 на Wayback Machine. Water Sci. Tech. 23:879-887.
  15. ^ Эйслаби Дж., Маклеод М. и Р. Фрейзер. Возможность биодеградации углеводородов в почве в зависимости от Росса в Антарктиде. Appl. Microbiol. Biotechnol. 49:210-214.
  16. ^ Поступление микрополиспоры в LPSN; Euzéby, J.P. (1997). «Список названий бактерий с позиции в номенклатуре: папка, доступная в Интернете». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 47 (2): 590–2. Дои:10.1099/00207713-47-2-590. PMID  9103655.