Родной контакт - Native contact - Wikipedia

В сворачивание белка, а родной контакт это контакт между боковые цепи из двух аминокислоты которые не соседствуют в аминокислотная последовательность (т.е. они находятся на расстоянии более четырех остатков друг от друга в первичной последовательности, чтобы удалить тривиальные контакты от i до i + 4 вдоль альфа-спиралей), но они пространственно близки в белковом родное государство третичная структура. Доля нативных контактов, воспроизводимых в той или иной структуре, часто используется как координата реакции для измерения отклонения от естественного состояния конструкций, изготовленных в процессе молекулярная динамика моделирования или в тестах предсказание структуры белка методы.

В контактный заказ является мерой локализации нативных контактов белка; то есть расстояние последовательности между аминокислотами, которые образуют контакты. Считается, что белки с низким порядком контакта складываются быстрее, и некоторые из них могут быть кандидатами на складывание под гору.