Mothur - Mothur

мотылек
Оригинальный автор (ы)Д-р Патрик Шлосс и др.[1]
изначальный выпуск13 февраля 2009 г.; 11 лет назад (2009-02-13)[2]
Стабильный выпуск1.43.0 [3] (21 октября 2019 г.; 13 месяцев назад (2019-10-21)[3]) [±]
Репозиторийgithub.com/ mothur/ mothur/
Написано вC ++[1][4]
Операционная системаWindows, источник доступен для Unix-подобный[1][5]
РазмерОт 13,50 МБ (Windows) до 22,80 МБ (MacOS)[6]
Доступно ванглийский
ТипПрограммное обеспечение для биоинформатики
ЛицензияGNU GPL v3[1][7]
Интернет сайтwww.mothur.org Отредактируйте это в Викиданных

мотылек является Открытый исходный код программный пакет для биоинформатика обработка данных.[8] Пакет часто используется при анализе ДНК от некультурных микробов. mothur способен обрабатывать данные, полученные из нескольких Секвенирование ДНК методы, включая пиросеквенирование 454, Illumina HiSeq и MiSeq, Sanger, PacBio и IonTorrent.[9] Первый выпуск mothur произошел в 2009 году.[10] О выпуске mothur было объявлено в публикации в журнале. Прикладная и экологическая микробиология.[1] По состоянию на 12 сентября 2015 года на статью, посвященную mothur, ссылались еще 3 992 исследования.

внешняя ссылка

Рекомендации

  1. ^ а б c d е Schloss, P.D .; Westcott, S.L .; Рябин, Т .; Hall, J. R .; Hartmann, M .; Hollister, E.B .; Лесневский, Р. А .; Oakley, B.B .; Паркс, Д. Х .; Робинсон, С. Дж .; Sahl, J. W .; Стрес, Б .; Thallinger, G.G .; Ван Хорн, Д. Дж .; Вебер, К. Ф. (2009). «Представляем mothur: программное обеспечение с открытым исходным кодом, независимое от платформы и поддерживаемое сообществом для описания и сравнения микробных сообществ». Прикладная и экологическая микробиология. Американское общество микробиологии. 75 (23): 7537–7541. Дои:10.1128 / aem.01541-09. ISSN  0099-2240. ЧВК  2786419. PMID  19801464.
  2. ^ «Мотур v.1.0.0». mothur вики. Получено 2019-11-27.
  3. ^ а б «Релизы». GitHub. Получено 2019-11-27.
  4. ^ "mothur / mothur". GitHub. Получено 2019-11-27.
  5. ^ "Установка". mothur вики. Получено 2019-11-27.
  6. ^ «Выпуск версии 1.43.0». GitHub. Получено 2019-11-27.
  7. ^ "License.md". GitHub. Получено 2019-11-27.
  8. ^ Ricke, S.C .; Атунгулу, Г.Г .; Дождевая вода, C .; Парк, С. (2017). Системы и анализ безопасности пищевых продуктов и кормов. Elsevier Science. п. 359. ISBN  978-0-12-849888-0. Получено 13 июня, 2018.
  9. ^ Orcutt, B.N .; Sylvan, J.B .; Сантелли, К. (2017). Последние достижения в геомикробиологии океанской коры. Темы исследований Frontiers. п. 264. ISBN  978-2-88945-283-5. Получено 13 июня, 2018.
  10. ^ Картер, Д.О .; Tomberlin, J.K .; Benbow, M.E .; Меткалф, Дж. Л. (2017). Судебная микробиология. Судебная медицина в центре внимания. Вайли. п. 180. ISBN  978-1-119-06257-8. Получено 13 июня, 2018.