Семейство гликозид гидролаз 13 - Glycoside hydrolase family 13
| Альфа-амилаза, N-концевой ig-подобный домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура термоактиномицета vulgaris r-47 альфа-амилазы 1 (tvai) мутанта d356n / e396q в комплексе с p2, олигосахаридом модели пуллулана | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Альфа-амилаза_N | ||||||||
| Pfam | PF02903 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR004185 | ||||||||
| SCOP2 | 1см / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
| Каталитический домен альфа-амилазы | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 циклодекстринглюканотрансфераза (e.c.2.4.1.19) (cgtase) | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Альфа-амилаза | ||||||||
| Pfam | PF00128 | ||||||||
| Pfam клан | CL0058 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006047 | ||||||||
| SCOP2 | 1ppi / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| CAZy | GH13 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 13 это семья из гликозидгидролазы.
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать то гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]
Ферменты, содержащие этот домен, относятся к семейству 13 (КАЗИ GH_13 ) гликозилгидролаз. Мальтогенный альфа-амилаза представляет собой фермент, который катализирует гидролиз (1-4) -альфа-D-глюкозидных связей в полисахариды для удаления последовательных остатков альфа-мальтозы с невосстанавливающих концов цепей при превращении крахмал к мальтоза. Другие ферменты этого семейства включают неопуллуланазу, которая гидролизует пуллулан к панорама, и цикломальтодекстриназа, который гидролизует циклодекстрины.
Рекомендации
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК 41477. PMID 7624375.
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Строения и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК 1217404. PMID 8687420.
- ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Выпуск базы данных): D490–5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК 3965031. PMID 24270786.
- ^ «Семейство гликозидгидролаз 13». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. PMID 29040563.
