FepA - FepA - Wikipedia

Многие бактерии выделяют небольшие железосвязывающие молекулы, называемые сидерофоры, которые сильно связываются с железо ионы. FepA является интегральным бактериальная внешняя мембрана белок порин это принадлежит рецептор внешней мембраны семья и обеспечивает активный транспорт железа, связанного сидерофором энтеробактин из внеклеточного пространства в периплазма из Грамотрицательные бактерии. Также было показано, что FepA может транспортировать витамин B12, и колицины B и D.[1] Этот белок принадлежит к семейству лиганд-зависимые белковые каналы.

Поскольку к внешней мембране напрямую не поступает энергия, энергия для управления транспортом энтеробактина железа с помощью FepA происходит от движущая сила протона (электрохимический градиент ), генерируемые комплексом внутренней мембраны TonB – ExbB – ExbD. Эта сила физически передается в FepA посредством прямого взаимодействия между FepA и ТоннБ.

Структура

Изображенный ион трехвалентного железа связан 3 группами катехина, как это происходит с молекулой энтеробактина.

С помощью Рентгеновская кристаллография структура FepA оказалась 724-остаток 22-витой β-ствол. Внеклеточная сторона ствола содержит петли, которые действуют как сайты связывания лиганда с высоким сродством и высокой специфичностью для энтеробактина железа. В N-конец образует меньший домен вилки внутри гидрофильный ствол, эффективно закрывающий поры. Исследования FhuA, похожий ТоннБ -зависимый переносчик внешней мембраны, показывают, что взаимодействие N-концевого домена с внутренними стенками поры усилено девятью солевыми мостиками и более 60 водородными связями. N-конец также имеет две внеклеточные петли в поре, которые, как считается, помогают в передаче сигнала между связыванием лиганда и TonB-опосредованным транспортом, хотя точный механизм не ясен. FepA содержат область, называемую коробкой TonB, которая включает, по крайней мере, остатки пролина и глицина.[2][3]

Энтеробактин это циклический три-сложный эфир 2,3-дигидроксибензоилсерина с молекулярной массой 719 Да. Он связывает ионы трехвалентного железа, используя шесть атомов кислорода. катехол группы, что дает общий заряд −3. Как привязка катехол, энтеробактин, как полагают, также обладает тройной симметрией, рассекающей металлический центр.[4]

Функция

Железо обычно не всегда доступно в окружающей среде, в которой находится эта группа бактерий. Однако железо необходимо для поддержания жизни из-за его роли в коферментах дыхания и синтезе ДНК, поэтому бактерии должны адаптироваться, чтобы иметь механизм потребления железа. . Потому что Fe3+ имеет очень низкую растворимость, большая часть Fe3+ ионы в окружающей среде бактерий (например, в почве) существуют в виде оксидов или гидроксидов железа, и поэтому количество свободного Fe3+ низкий. Следовательно, микробы превратились в секретные сидерофоры, Fe3+-связывающие пептиды в окружающую среду и затем активно транспортируют Fe3+-комплекс обратно в камеру активный транспорт Это также можно увидеть с патогенными бактериями внутри хозяина, где железо прочно связано гемоглобин, трансферрин, лактоферрин и ферритин, и поэтому с низкой концентрацией (10−24 моль л−1). Здесь он секретирует сидерофоры, которые имеют более высокое сродство (с константой образования, или ([ML]) / ([M] [L]), 1049) в Fe3+ чем железосвязывающие белки хозяина, поэтому оно удаляет железо и затем переносится внутрь клетки. бацилла сибирской язвы, а грамположительные бактерии[5] что вызывает сибирская язва, секретирует два сидерофоров: бациллибактин и петробактин.кишечная палочка секретирует перенос многих железо-сидерофоров, но продуцирует только один сидерофор - энтеробактин. Рецептор энтеробактина железа (FepA) распознает катехолатную часть энтеробактина железа (FeEnt) и транспортирует ее через внешнюю мембрану из внеклеточного пространства в периплазму. Предполагается, что привязка состоит из двух этапов:[6] быстрый шаг, который распознает FeEnt, и более медленный шаг, который может быть первым шагом в транслокации - подготовка комплекса к транслокации. Обе стадии происходят независимо от комплекса TonB – ExbB – ExbD и обеспечиваемой им движущей силы протона. периплазма FeEnt связывается с FepB и передается в интегральные белки внутренней мембраны FepG и FepD посредством активного транспорта с энергией, обеспечиваемой гидролизом АТФ, катализируемым цитоплазматическим FepC. В цитоплазме энтеробактинэстераза Fes гидролизуется, и это расщепляет энтеробактин, высвобождая Fe3+ который впоследствии будет восстановлен тем же белком, Fes, до Fe2+.

Возможные механизмы

Когда энтеробактин связывает трехвалентное железо, это как изменяет трехмерную конформацию молекулы, так и изменяет заряд с нейтрального на отрицательный 3. Сайт связывания FepA, образованный внеклеточными петлями, состоит из положительно заряженных аминокислот.[7][8] Сочетание специфичности заряда и ограничения размера ствола делает импорт FepA высокоспецифичным для энтеробактина железа.

Механизм транспортировки описан как воздушный шлюз. Когда лиганд связан, предполагается, что он закрывает поры на внеклеточной стороне, предотвращая, таким образом, выход чего-либо через поры. Затем FepA взаимодействует с TonB через консенсусную последовательность из 5 аминокислот, которая вызывает изменение N-конца, открывая канал на периплазматическую сторону.[9] Это позволит FepA транспортировать энтеробактин железа, не позволяя ионам и небольшим молекулам проходить в любом направлении.

Когда лиганд связывается с помощью FepA, конформация N-концевого домена изменяется так, что поры открываются. Существуют разногласия относительно того, как открывается пространство внутри цилиндра, чтобы лиганд мог пройти. Либо N-концевой домен заглушки остается внутри цилиндра и претерпевает конформационные изменения, создавая пору, либо он временно выпадает из цилиндра. Была выдвинута гипотеза, что энергетически бессмысленно удалять весь N-концевой домен для транслокации, потому что для этого требуется разрыв солевых мостиков и многочисленных водородных связей, однако, поскольку цилиндр заполнен водой, необходимая энергия будет быть намного меньше, чем считалось ранее.[7]

Роль N-конца раскрывается с помощью делеционной мутации N-концевой пробки; белок все еще мог быть вставлен в мембрану, но он действует как неселективная пора для более крупных молекул, что проявляется в повышенной проницаемости клетки для мальтотетраоза, мальтопентаоза, феррихром, а также несколько антибиотики включая альбомицин, ванкомицин и бацитрацин. Однако к этому следует относиться с осторожностью, так как форма цилиндра может измениться при отсутствии N-концевой заглушки.

Рекомендации

  1. ^ S, Бьюкенен; B, Смит; L, Венкатрамани; D, ся; L, Эссер; М, Пальниткар; Р, Чакраборти; Д. ван дер Хельм; Дж., Дайзенхофер (1999). «Кристаллическая структура активного транспортера внешней мембраны FepA из Escherichia coli». Структурная биология природы. 6 (1): 56–63. Дои:10.1038/4931. PMID  9886293.
  2. ^ Дайзенхофер, Иоганн; Бьюкенен, Сьюзен К .; Smith, Barbara S .; Венкатрамани, Лалита; Ся, Ди; Эссер, Лотар; Пальниткар, Майя; Чакраборти, Ранджан; Хельм, Дик ван дер (1999). «Цитата из природы». Структурная биология природы. 6 (1): 56–63. Дои:10.1038/4931. PMID  9886293.
  3. ^ Нойнай, Николай; Гийе, Мод; Трэвис Дж. Барнард; Бьюкенен, Сьюзан К. (01.01.2010). «Транспортеры, зависящие от тонны B: регулирование, структура и функции». Ежегодный обзор микробиологии. 64 (1): 43–60. Дои:10.1146 / annurev.micro.112408.134247. ЧВК  3108441. PMID  20420522.
  4. ^ Раймонд, К; Dertz, E; Ким, S (2003). «Энтеробактин: архетип микробного транспорта железа». PNAS. 100 (7): 3584–3588. Дои:10.1073 / pnas.0630018100. ЧВК  152965. PMID  12655062.
  5. ^ Спенсер, Р. К. (2003). "Бацилла сибирской язвы". Журнал клинической патологии. 56 (3): 182–187. Дои:10.1136 / jcp.56.3.182. ЧВК  1769905. PMID  12610093.
  6. ^ Пэйн, М; Иго, Дж; Cao, Z; Фостер, S; Ньютон, S; Клебба, П (1997). «Кинетика двухфазного связывания между FepA и его лигандами». Журнал биологической химии. 272 (35): 21950–21955. Дои:10.1074 / jbc.272.35.21950. PMID  9268330.
  7. ^ а б Клебба, Филипп Э. (01.09.2003). «Три парадокса поглощения энтеробактина железа». Границы биологических наук. 8 (6): s1422–1436. Дои:10.2741/1233. ISSN  1093-9946. PMID  12957833.
  8. ^ Ньютон, SMC; и другие. (1997). «Двойной мутагенез кластера положительного заряда в лиганд-связывающем сайте рецептора энтеробактина железа, FepA». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 94 (9): 4560–4565. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4560. ЧВК  20762. PMID  9114029.
  9. ^ Schramm, E; и другие. (1987). «Нуклеотидная последовательность гена активности колицина B cbs: консенсусный пентапептид среди TonB-зависимых колицинов и рецепторов». J. Bacteriol. (7): 3350–3357.