Эдвард С. Холмс - Edward C. Holmes

Эдди Холмс

Королевское общество Эдварда Холмса.jpg
Эдди Холмс в Королевское общество день приема в июле 2017 г.
Родившийся
Эдвард Чарльз Холмс

(1965-02-26) 26 февраля 1965 г. (возраст 55)[1]
Альма-матерЛондонский университет (Бакалавр)
Кембриджский университет (Кандидат наук)
ИзвестенМолекулярная эволюция: филогенетический подход[2]
Награды
Научная карьера
ПоляВирусология
Эволюционная биология[5]
УчрежденияСиднейский университет
Государственный университет Пенсильвании
Оксфордский университет
Эдинбургский университет
Калифорнийский университет в Дэвисе[3]
ТезисПаттерн и процесс в молекулярной эволюции отряда приматов  (1990)
Академические консультантыАдриан Фрайдей[1]
ВлиянияПол Харви
Интернет сайтСидней.edu.au/наука/люди/ Эдвард.holmes.php

Эдвард Чарльз Холмс ФРС FAA[6] (род. 1965, Великобритания)[1] является эволюционным биологом и вирусологом, а с 2012 г. Национальный совет здравоохранения и медицинских исследований (NHMRC) Австралия Парень и профессор Сиднейский университет.[5][7][8] Он также является почетным приглашенным профессором в Университет Фудань, Шанхай, Китай (2019-настоящее время), а также приглашенный профессор в Китайский центр по контролю и профилактике заболеваний, Пекин, Китай (2014-настоящее время)[9]

Образование

Холмс получил образование в Университетский колледж Лондона где он получил степень бакалавра наук в Антропология в 1986 г.[1] Затем он переехал в Кембриджский университет где ему была присвоена степень доктора философии в Зоология в 1990 году[10][1] для исследования молекулярная эволюция в приматы под руководством Адриан Фрайдей.[1]

Исследования и карьера

Холмс использовал геномный и филогенетический подходов к выявлению основных механизмов эволюция вируса и определили генетические и эпидемиологические процессы, объясняющие, как вирусы преодолевают границы видов и распространяются в новых хозяевах.[6] Его работа раскрыла происхождение, эволюцию и молекулярную эпидемиология важных патогены человека включая Гепатит С,[11][12] грипп,[13][14] ВИЧ[15] и денге,[16] и позволил более точно оценить, какие типы вирусов с наибольшей вероятностью появятся в человеческих популяциях и будут ли они распространяться от человека к человеку.[6] Его недавнее исследование дало фундаментальное представление о широте и биоразнообразие вирусного мира.[6]

Холмс написал Эволюция и появление РНК-вирусов[17] часть Оксфордской серии по экологии и эволюции под редакцией Пол Х. Харви и Роберт М. Мэй. Он также является соавтором учебника. Молекулярная эволюция: филогенетический подход с Род Пейдж.[2] С 1994 года под его руководством 26 докторантов.[1] включая Томаса Гилберта,[18] Кристофер Вулк,[19] Полли Уокер,[20] Чарльз Эдвардс,[21] Салли Твидди,[22] Патрисия Дэвис,[23] Майкл Воробей,[24]Гарет Дженкинс,[25] Марию а А Лварес,[26] Эндрю Джексон,[27] и Анджела Брейггеманн.[28]

SARS-CoV-2

Как ведущий вирусолог, Холмс является соавтором публикации последовательности генома SARS-CoV-2.[29][30] и ранние описания болезни.[31] Холмс занимал видное место в комментариях, касающихся его происхождения. В марте 2020 года он стал соавтором статьи под названием Ближайшее происхождение SARS-CoV-2, опубликовано в Природа Медицина,[32] которые опровергли предположение, что вирус мог просочиться из исследовательского центра.[33][34]

В апреле Сиднейский университет опубликовал заявление Холмса, в котором говорилось: "Нет никаких доказательств того, что SARS-CoV-2, вирус, вызывающий COVID-19 у людей, возник в лаборатории в Ухань, Китай", и все свидетельства указывают на его происхождение от вида животных.[35] Об этих взглядах сообщалось в Financial Times в мае 2020 года.[36]

Институциональная принадлежность

До переезда в Сидней в 2012 году Холмс занимал академические должности в различных университетах Великобритании и США, в том числе:

1990–1991Калифорнийский университет в Дэвисе,[1] постдокторант под руководством Чарльза Х. Лэнгли.
1991–1993Эдинбургский университет,[1] постдок, финансируемый Великобританией Совет медицинских исследований (MRC).[1][11]
1993–2004Оксфордский университет[1] где он был членом Новый колледж, Оксфорд и Колледж Святой Екатерины, Оксфорд
2005–2012Государственный университет Пенсильвании, Профессор биологии[1]

Его исследование финансировалось Королевское общество,[6] Великобритания Совет по исследованиям биотехнологии и биологических наук (BBSRC), канадский Совет по естественным наукам и инженерным исследованиям (NSERC), Родос Траст, Wellcome Trust, Соединенные Штаты Национальные институты здоровья (НАЦИОНАЛЬНЫЕ ИНСТИТУТЫ ЗДРАВООХРАНЕНИЯ США), Национальный фонд науки (NSF), Австралийский исследовательский совет и Австралийский национальный совет по здравоохранению и медицинским исследованиям (NHMRC).[1][3][37]

Награды и награды

Холмс был избран Член Австралийской академии наук (FAA) в 2015 году и Член Королевского общества (ФРС) в 2017 году.[6] В 2017 году награжден Австралийская стипендия лауреатов.[4] Он был награжден Медаль за науку, Лондонское зоологическое общество в 2003 г.[1] В октябре 2020 года Холмс был назван ученым года Нового Южного Уэльса.[38]

Личная жизнь

Холмс перечисляет свои развлечения как Китовый пляж, Новый Южный Уэльс, электрогитары и Футбольный клуб Астон Вилла.[39]

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о Холмс, Эдди (2017). "Эдвард С. Холмс - Биографическая справка". profile.sydney.edu.au. Сиднейский университет. Архивировано из оригинал 8 августа 2017 г.
  2. ^ а б Пейдж, Родерик Д. М .; Холмс, Эдвард С. (1998). Молекулярная эволюция: филогенетический подход. Оксфорд: Blackwell Science. ISBN  9780865428898. OCLC  47011609.
  3. ^ а б c d Эдвард С. Холмс ORCID  0000-0001-9596-3552
  4. ^ а б «Стипендии и учебные центры ускоряют исследовательский потенциал». Сиднейский университет. 5 июн 2017. Получено 21 января 2018.
  5. ^ а б Эдвард С. Холмс публикации, проиндексированные Google ученый Отредактируйте это в Викиданных
  6. ^ а б c d е ж Анон (2017). "Профессор Эдвард Холмс FRS". royalsociety.org. Лондон: Королевское общество. Архивировано из оригинал 11 мая 2017 г. Одно или несколько предыдущих предложений включают текст с веб-сайта royalsociety.org, где:

    "Весь текст, опубликованный под заголовком" Биография "на страницах профиля участника, доступен в Международная лицензия Creative Commons Attribution 4.0." --«Положения, условия и политика Королевского общества». Архивировано 11 ноября 2016 года.. Получено 9 марта 2016.CS1 maint: BOT: статус исходного URL-адреса неизвестен (связь)

  7. ^ Эдвард С. Холмс публикации, проиндексированные Scopus библиографическая база данных. (требуется подписка)
  8. ^ Эдвард С. Холмс публикации из Европа PubMed Central
  9. ^ Сиднейский университет, академические профили, 2020
  10. ^ Холмс, Эдвард Чарльз (1989). Паттерн и процесс молекулярной эволюции отряда приматов (Кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC  53489363. EThOS  uk.bl.ethos.317751 ProQuest  1771542055.
  11. ^ а б Симмондс, Питер; Альберти, Альфредо; Альтер, Харви Дж .; Бонино, Ферруччо; Брэдли, Дэниел В .; Брехо, Кристиан; Брауэр, Йоханнес Т .; Чан, Шиу-Ван; Чаяма, Кадзуаки; Чен, Дин-Шинн; Чу, Куай-Лим; Коломбо, Массимо; Cuypers, H. Theo M .; Дата, Такаясу; Dusheiko, Geoff M .; Эстебан, Хуан I .; Фэй, Оскар; Hadziyannis, S.J .; Хан, Джанг; Хатзакис, Ангелос; Холмс, Эдди С.; Хотта, Хак; Хоутон, Майкл; Ирвин, Брюс; Кохара, Мичинори; Кольберг, Дженис А .; Куо, Джордж; Lau, Johnson Y. N .; Лели, П. Нико; Maertens, Geert; Макомиш, Фиона; Миямура, Тацуо; Мизоками, Масаси; Номото, Акио; Принц, Альфред М .; Reesink, Henk W .; Райс, Чарли; Роггендорф, Майкл; Schalm, Solko W .; Шиката, Тошио; Симотохно, Кунитада; Стуйвер, Ливен; Трепо, Кристиан; Вайнер, Эми; Yap, Peng L .; Урдя, Микки С. (1994). «Предлагаемая система номенклатуры генотипов вируса гепатита С». Гепатология. 19 (5): 1321–1324. Дои:10.1002 / hep.1840190538. ISSN  0270-9139. PMID  8175159. S2CID  1573464.
  12. ^ Simmonds, P .; Irvine, B .; Yap, P. L .; Кольберг, Дж .; Chan, S.-W .; Cha, T.-A .; Beall, E .; Urdea, M. S .; Holmes, E.C .; МакОмиш, Ф. (1993). «Классификация вируса гепатита С на шесть основных генотипов и ряд подтипов с помощью филогенетического анализа области NS-5». Журнал общей вирусологии. 74 (11): 2391–2399. Дои:10.1099/0022-1317-74-11-2391. ISSN  0022-1317. PMID  8245854.
  13. ^ Суббарао, Канта; Тонг, Сусян; Чжу, Сюэён; Ли, Ян; Ши, Ман; Чжан, Цзин; Буржуа, Мелисса; Ян, Хуа; Чен, Сяньфэн; Рекуенко, Серджио; Гомес, Хорхе; Чен, Ли-Мэй; Джонсон, Адам; Дао, Инь; Дрейфус, Сирил; Ю, Венли; Макбрайд, Райан; Карни, Пол Дж .; Гилберт, Эми Т .; Чанг, Джесси; Го, Чжу; Дэвис, Чарльз Т .; Полсон, Джеймс С.; Стивенс, Джеймс; Rupprecht, Charles E .; Холмс, Эдвард С .; Уилсон, Ян А .; Донис, Рубен О. (2013). "Летучие мыши Нового Света являются носителями различных вирусов гриппа А". Патогены PLOS. 9 (10): e1003657. Дои:10.1371 / journal.ppat.1003657. ISSN  1553-7374. ЧВК  3794996. PMID  24130481. открытый доступ
  14. ^ Рамбаут, Андрей; Pybus, Оливер G .; Нельсон, Марта I .; Вибу, Сесиль; Таубенбергер, Джеффри К .; Холмс, Эдвард С. (2008). «Геномная и эпидемиологическая динамика вируса гриппа человека А». Природа. 453 (7195): 615–619. Bibcode:2008Натура.453..615р. Дои:10.1038 / природа06945. ЧВК  2441973. PMID  18418375. закрытый доступ
  15. ^ Лесли, А. Дж .; Pfafferott, KJ; Четти, П; Draenert, R; Аддо, М М; Фини, М; Тан, Y; Холмс, E C; Аллен, Т; Prado, JG; Альтфельд, М; Брандер, C; Диксон, К; Рамдут, Д; Jeena, P; Thomas, S.A.; Иоанна, ул. Роуч, Т. А; Купфер, Б; Луцци, G; Эдвардс, А; Тейлор, Дж; Lyall, H; Тюдор-Уильямс, G; Novelli, V; Мартинес-Пикадо, Дж .; Kiepiela, P; Уокер, Б. Д.; Гоулдер, П. Дж. Р. (2004). «Эволюция ВИЧ: мутации ускользания CTL и реверсия после передачи». Природа Медицина. 10 (3): 282–289. Дои:10,1038 / нм992. ISSN  1078-8956. PMID  14770175. S2CID  28756735.
  16. ^ Холмс, Э; Твидди, S (2003). «Происхождение, возникновение и эволюционная генетика вируса денге». Инфекция, генетика и эволюция. 3 (1): 19–28. Дои:10.1016 / S1567-1348 (03) 00004-2. ISSN  1567-1348. PMID  12797969. (требуется подписка)
  17. ^ Холмс, Эдвард С. (2009). Эволюция и появление РНК-вирусов. Оксфордская серия по экологии и эволюции. Оксфорд, Нью-Йорк: Oxford University Press. ISBN  9780199211135.
  18. ^ Гилберт, Маркус Томас Пиус (2003). Оценка использования человеческих образцов в исследованиях древней ДНК (Докторская диссертация). Оксфордский университет. OCLC  61188157. EThOS  uk.bl.ethos.404119. открытый доступ
  19. ^ Woelk, Кристофер Харрон. (2002). Адаптивная эволюция эмерджентных и эндемичных вирусов (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.249496.
  20. ^ Уокер, Полли Роуз (2006). Эволюция и инфекционность вирусов ВИЧ-1 подтипа С (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.442985.
  21. ^ Эдвардс, Чарльз Т. Т. (2004). Эволюция ВИЧ-1 при передаче и хронической инфекции (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.410560.
  22. ^ Твидди, Салли Сюзанна (2002). Молекулярная эпидемиология и эволюция вируса денге (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.269490.
  23. ^ Дэвис, Патрисия (2005). Молекулярная эволюция и генетическая эпидемиология лиссавирусов (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.433259.
  24. ^ Воробей, Майкл (2002). Возникновение и влияние вирусной рекомбинации (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.249612.
  25. ^ Дженкинс, Гарет Марк (2001). Детерминанты молекулярной эволюции РНК-вирусов (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.365413.
  26. ^ Allvarez, Марила С. Арместо (2004). Молекулярные исследования вируса клещевого энцефалита (Докторская диссертация). Оксфордский университет. OCLC  74119965. EThOS  uk.bl.ethos.413476.
  27. ^ Джексон, Эндрю (2004). Применение филогенетического примирения к изучению коэволюции (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.403742.
  28. ^ Брейггеманн, Анджела Бет (2004). Изучение популяционной биологии и потенциала инвазивных заболеваний Streptococcus pneumoniae (Докторская диссертация). Оксфордский университет. EThOS  uk.bl.ethos.400557.
  29. ^ Лу, Руцзянь; Чжао, Сян; Ли, Хуан; Ниу, Пейхуа; Ян, Бо; Ву, Хунлун; Ван, Венлинг; Песня, Хао; Хуанг, Баоин; Чжу, На; Би, Юхай; Ма, Сюэцзюнь; Жан, Фасян; Ван, Лян; Ху, Дао; Чжоу, Хун; Ху, Чжэньхун; Чжоу, Вэйминь; Чжао, Ли; Чен, Цзин; Мэн, Яо; Ван, Цзи; Линь, Ян; Юань, Цзяньин; Се, Чжихао; Ма, Джинминь; Лю, Уильям Дж; Ван, Даян; Сюй, Вэньбо; Холмс, Эдвард С; Гао, Джордж Ф; Ву, Гуйчжэнь; Чен, Вэйцзюнь; Ши, Вэйфэн; Тан, Вэньцзе (2020). «Геномная характеристика и эпидемиология нового коронавируса 2019 года: значение для происхождения вируса и связывания с рецептором». Ланцет. 395 (10224): 565–574. Дои:10.1016 / S0140-6736 (20) 30251-8. ISSN  0140-6736. ЧВК  7159086. PMID  32007145.
  30. ^ Чжан, Юн-Чжэнь; Холмс, Эдвард С. (2020). «Геномная перспектива происхождения и появления SARS-CoV-2». Клетка. 181 (2): 223–227. Дои:10.1016 / j.cell.2020.03.035. ISSN  0092-8674. ЧВК  7194821. PMID  32220310.
  31. ^ Ву, Фань; Чжао, Вс; Ю, Бин; Чен, Ян-Мэй; Ван, Вэнь; Сун, Чжи-Ган; Ху, Йи; Тао, Чжао-Ву; Тиан, Цзюнь-Хуа; Пей, юань-юань; Юань, Мин-Ли; Чжан, Юй-Лин; Дай, Фа-Хуэй; Лю, Йи; Ван, Ци-Минь; Чжэн, Цзяо-Цзяо; Сюй, Линь; Холмс, Эдвард С .; Чжан, Юн-Чжэнь (2020). «Новый коронавирус, связанный с респираторным заболеванием человека в Китае». Природа. 579 (7798): 265–269. Bibcode:2020Натура 579..265Вт. Дои:10.1038 / s41586-020-2008-3. ISSN  0028-0836. ЧВК  7094943. PMID  32015508.
  32. ^ Андерсен, Кристиан Г .; Рамбаут Андрей; Липкин, В. Ян; Холмс, Эдвард С .; Гарри, Роберт Ф. (2020). «Проксимальное происхождение SARS-CoV-2». Природа Медицина. 26 (4): 450–452. Дои:10.1038 / s41591-020-0820-9. ISSN  1078-8956. ЧВК  7095063. PMID  32284615.
  33. ^ Спинни, Лаура (28 марта 2020 г.). "Виноваты ли промышленные фермерские хозяйства в коронавирусе?". хранитель. Получено 1 ноября 2020.
  34. ^ Манникс, Лиам (24 апреля 2020 г.). «Коронавирус в Австралии: ученые опровергают теорию COVID-19, сбежавшего из лаборатории». Sydney Morning Herald. Получено 1 ноября 2020.
  35. ^ Холмс, Эдвард (16 апреля 2020 г.). «Заявление профессора Эдварда Холмса о вирусе SARS-CoV-2: о происхождении вируса, вызывающего COVID-19». Сиднейский университет. Получено 1 ноября 2020.
  36. ^ Вайнланд, Дон; Мэнсон, Катрина (5 мая 2020 г.). «Как лаборатория в Ухане оказалась втянутой в глобальную игру по обвинению в коронавирусе». Financial Times. Получено 1 ноября 2020.
  37. ^ «Профессор Холмс, движимый поисками научной истины». Сиднейский университет. Получено 15 сентября 2020.
  38. ^ Обюссон, Кейт (26 октября 2020 г.). «Профессор Эдвард Холмс, бунтарь от вирусов, назван ученым года в Новом Южном Уэльсе». Sydney Morning Herald. Получено 26 октября 2020.
  39. ^ Фэллон, Бейли (2015). «Знакомьтесь, наши редакторы: интервью с Эдвардом Холмсом». blogs.royalsociety.org. Архивировано из оригинал 19 ноября 2016 г.